Nabídka kvalifikačních prací

Tajemné rody sinic – ulov, zdokumentuj, ochoč a osekvenuj!

Sinice byly, jsou a budou jednou z nejkrásnějších skupin organismů na Zemi, a přesto o řadě jejich rodů stále víme překvapivě málo. I v době moderní molekulární biologie existují celé rody, které jsou morfologicky dobře rozlišitelné, ale prakticky neprozkoumané.

Mezi takové zanedbávané, leč nádherné rody patří namátkou (ale nikoli výhradně) kokální Aphanocapsa, Cyanogranis, Cyanotetras, Pannus, Rhabdoderma, z vláknitých pak Planktolyngbya, Lyngbya, Phormidium, Porphyrosiphon, Tychonema, Symploca či heterocytózní Dichothrix, Dolichospermum a Hapalosiphon.

Cílem diplomové práce bude vybrat jeden (nebo několik) těchto rodů a komplexně je zpracovat od terénu až po DNA:

•          zpracovat literární rešerši o dosud popsaných druzích vybraného rodu(rodů), jejich známých ekologických preferencích a rozšíření;

•          prozkoumat různorodé lokality s potenciálním výskytem vybraných druhů a mikroskopicky zdokumentovat jejich morfologii;

•          izolovat ze vzorků jejich čisté kultury, získat fylogeneticky relevantní sekvence DNA, případně celý genom a provést fylogenetické analýzy.

•          Součástí může v případě úspěšné izolace kultur být i práce na elektronovém mikroskopu.

Je velmi pravděpodobné, že získaná data budou první svého druhu na světě. Práce tak má reálný potenciál vést k publikaci v impaktovaných časopisech a dát studentovi silný základ pro další akademickou dráhu.

Školitel: Jan Kaštovský, Jan Pokorný