lIDÉ
BC. jan pokorný
Kontakt:
Katedra botaniky PřF JU
Na Zlaté stoce 1
České Budějovice
370 05
Tel.: 389 032 340
E-mail: pokorj13_at_prf.jcu.cz
Střední škola:
2011 - 2019: Gymnázium J. V. Jirsíka, České Budějovice
Vysoká škola:
Bakalářské studium:
2020 - 2022: Přírodovědecká fakulta JU
Bakalářská práce: Fylogeneze a taxonomie vybraných druhů sinic s využitím metody single cell sequencing.
Školitel: Jan Kaštovský
Cíle práce:
vyizolovat jednotlivé buňky zájmových sinic se vzorků z NP Yellowstone i ze vzorků z ČR a udělat k nim morfologickou dokumentaci;
tyto získané buňky použít jako materiál pro izolaci DNA, získat jejich sekvenci;
fylogeneticky získaná data vyhodnotit.
Magisterské studium:
2022 - dosud: Přírodovědecká fakulta JU
Bakalářská práce: Polyfázická analýza fylogenetických vztahů rodů Merismopedia a Microcrocis.
Školitel: Lenka Štenclová
Cíle práce:
vyizolovat jednotlivé buňky zájmových sinic se vzorků z NP Yellowstone i ze vzorků z ČR a udělat k nim morfologickou dokumentaci;
tyto získané buňky použít jako materiál pro izolaci DNA, získat jejich sekvenci;
fylogeneticky získaná data vyhodnotit.
Obory vědeckého zájmu:
taxonomie a fylogeneze sinic
Vědečtí zaměstnavatelé:
2019 - 2020: Biologické centrum AV ČR, SoWa
2022 - dosud: Katedra botaniky, PřF JU, České Budějovice
Granty:
2023 - dosud: GAČR 22-06374S "Sjednocení systematiky pomocí harmonizace polyfázické a genomové taxonomie", technik
2023: Studentská grantová agentura PřF JU " Polyfázická analýza vzájemných fylogenetických vztahů rodů Merismopedia a Microcrocis (Cyanobacteria)", řešitel
2022: LTAUSA-18008: "Fylogenetické zhodnocení obtížně kultivovatelných rodů sinic pomocí metody single-cell sequencing", technik
2021: Studentská grantová agentura PřF JU "Fylogeneze a taxonomie vybraných druhů sinic s využitím metody single cell sequencing", řešitel
Konference:
Pokorný, J. (2023) Polyphasic analysis of the phylogenetic relationship of the genera Merismopedia and Microcrocis (Cyanobacteria) (přednáška). 33. ročník studentské minikonference Chantransia, Telč, Česká republika.
Pokorný, J.; Kaštovský, J. a Štenclová, L. (2023) New insights into the phylogenetic relationship of the Merismopedia and Microcrocis (Cyanobacteria) genera (přednáška). 8th European Phycological Congress, Brest, Francie.
Pokorný, J.; Štenclová, L. a Kaštovský, J. (2023) New insights into the phylogenetic relationship of the Merismopedia and Microcrocis (Cyanobacteria) genera (přednáška). 64th Meeting of the Czech Phycological Society, Praha, Česká republika.
Pokorný, J. (2022) Brief contribution to the taxonomy and phylogeny of the family Merismopediaceae (přednáška). 32. ročník studentské minikonference Chantransia, Josefův Důl, Česká republika.
Pokorný, J., Štenclová, L. & Kaštovský, J. (2022) Brief contribution to the taxonomy and phylogeny of the family Merismopediaceae – the plot thickens (přednáška). 22nd Symposium of the International Association of Cyanophyte/Cyanobacteria Research, České Budějovice, Česká republika.
Pokorný, J. (2021) Phylogeny and taxonomy of selected cyanobacteria species using single cell sequencing (přednáška). 31. ročník studentské minikonference Chantransia, Tokániště, Česká republika.
Publikace:
Pokorný, J., Štenclová, L., Kaštovský, J. (2023): Unsuspected findings about phylogeny and ultrastructure of the enigmatic cyanobacterium Microcrocis geminata resulted in its epitypification and novel placement in Geminocystaceae. Fottea 23(1): 110-121. https://doi.org/10.5507/fot.2022.016
Angst, G., Pokorný, J., Mueller, C.W., Prater, I., Preusser, S., Kandeler, E., Meador, T., Straková, P., Hájek, T., van Buiten, G., Angst, Š. (2021): Soil texture affects the coupling of litter decomposition and soil organic matter formation. Soil Biology and Biochemistry 159, https://doi.org/10.1016/j.soilbio.2021.108302