Rod Dolichospermum patří mezi nejhojněji zastoupené planktonní sinice v tzv.vodních květech rybníků a přehradních nádrží. Vzhledem k masovému charakteru svého výskytu a potenciální produkci cyanotoxinů představují závažné riziko pro celý
ekosystém.
Rod Dolichospermum vznikl teprve nedávno, a sice vyčleněním planktonních zástupců z tradičního rodu Anabaena (v r. Anabaena nyní zůstaly pouze bentické, nárostové a půdní typy). Zahrnuje široké spektrum morfologicky různorodých, ale ne vždy jasně vyhraněných druhů, a představuje tak z taxonomického hlediska velice zapeklitou skupinu. Dosud nejčastěji studovaná část genomu, tj. 16S rRNA gen, není na druhové úrovni natolik rozrůzněn, aby se na základě jeho sekvence daly jednotlivé druhy spolehlivě odlišit. Nelze tedy zatím ani vytvořit taxonomickou hierarchii (systém), pomocí kterého by bylo možno druhy v rámci r. Dolichospermum klasifikovat (třídit).
Cílem nabízené práce bude osvojit si základy kultivace a práce s kmeny sinic a dále osekvenovat dosud vůbec nebo málo studované geny a na základě nich zmapovat fylogenetické vztahy (příbuznost) jednotlivých druhů r. Dolichospermum.
Diplomová práce by probíhala na HBÚ v laboratořích s vynikajícím vybavením a metodickým zázemím pro studium této problematiky. Práce je finančně podpořena projektem GAČR, který trvá do roku 2012.
Dle stupně studia bude zvolen rozsah práce, tj. druh a počet vybraných kmenů sinic r. Dolichospermum a studovaná část genomu. Práce je převážně laboratorní a je ji možné rozdělit mezi několik uchazečů, kteří budou případně moci svoje výsledky porovnat, ale nebudou na sobě vzájemně závislí. Bakalářská práce může být po dohodě zadána i jako literární rešerše na dané téma.
Školitel: Eliška Zapomělová
Konzultant: Klára Řeháková
