www.sinicearasy.cz

Tradiční sinicový rod Anabaena byl v nedávné době rozštěpen a ve skupině s tímto označením nyní zůstali neplanktonní zástupci, tj. bentické, nárostové a půdní druhy. Tyto sinice jsou díky svému ojedinělému výskytu oproti svým planktonním příbuzným (nyní rod Dolichospermum) mnohem méně prostudované. Jejich vzájemné fylogenetické vztahy nebyly dosud systematicky zmapovány; dostupné výsledky však naznačují, že zřejmě nepůjde o vývojově jednotnou skupinu. Málo se ví i o diverzitě druhů a jejich výskytu ve světě i v České republice. Jakékoli další informace o této skupině sinic jsou tedy žádoucí a cenné.
Cílem nabízené práce bude odebrat vzorky z vybraných lokalit a na nalezených taxonech r. Anabaena si osvojit základy izolace, kultivace a práce s kmeny sinic. Dalším cílem bude u vybraných kmenů r. Anabaena osekvenovat v taxonomii sinic nejčastěji studovaný gen 16S rRNA, případně další geny a na základě nich zmapovat fylogenetické vztahy (příbuznost) jednotlivých druhů r. Anabaena.
Diplomová práce by probíhala na HBÚ v laboratořích s vynikajícím vybavením a metodickým zázemím pro studium této problematiky. Práce je finančně podpořena projektem GAČR, který trvá do roku 2012.
Práci, která kombinuje terénní a laboratorní metodiku, je možno případně rozdělit i mezi několik studentů, kteří budou případně moci svoje výsledky porovnat, ale nebudou na sobě vzájemně závislí. Dle stupně studia bude zvolen rozsah práce, tj. druh a počet vybraných kmenů sinic r. Anabaena a studovaná část genomu. Bakalářská práce může být po dohodě zadána i jako literární rešerše na dané téma.

Školitel: Eliška Zapomělová (konzultant doktorandské práce)
Konzultant: Klára Řeháková (školitel doktorandské práce)