www.sinicearasy.cz

Taxonomie sinic a řas (Komárek, Kaštovský, Hauer)

V současnosti se hodně soustřeďujeme na systematiku sinic a to zejména na fylogenetické vztahy jednotlivých skupin s ohledem na jejich morfologii, ultrastrukturu buněk a sekvence genu pro 16S rRNA. Z ostatních skupin se u nás dobře studují zelené řasy, částečně i rozsivky. Zájemce o jiné taxonomické skupiny rovněž vřele uvítáme a díky přátelským vztahům mezi fykology a algology celého vesmíru jsme schopní (většinou) sehnat zasvěceného specialistu jako konzultanta.

Studentské práce zaměřené na tuto oblast je možno konat jak laboratorní, tak terénní, nebo jako příjemný mix obého.

Ekologie planktonních řas a sinic (Komárková, Znachor)

Většinou doména algologů z katedry biologie ekosystémů. Práce se soustřeďují zejména na planktonní sinice nádrží a to z mnoha pohledů – od taxonomického zhodnocení druhů a rodů, až po jejich toxicitu. Jsou to práce, použitelné třeba i v rámci aplikovaného výzkumu nebo vodárenské praxe – tudíž se pak trochu lépe hledá poststudijní uplatnění.

Ekologie extrémních biotopů (Komárek, Elster, Kaštovský, Hauer)

Řasy a sinice zejména, jsou schopné přežít drastické stresové podmínky. Proto se vyskytují na lokalitách, kde nic už není skoro nic jiného živého. Tyto podmínky jsou pro algology rájem pro sledování např. ekologických vztahů a tak dále. Hodně se soustřeďujeme na tropy a subtropy, polární oblasti (Arktidu i Antarktidu), ale i na termální prameny nebo smáčené stěny atd. Někdy poněkud dobrodružná specializace, což ovšem nemusí být na závadu.

Biotechnologie fototrofních mikroorganismů (Lukavský)

Kultivace a využití řas a sinic pro biotechnologie jsou pole zorané jen částečně a nabízí se tady celé řada vynikajících možností studia. K dispozici jsou, mimo jiné, i kmeny s úctyhodné sbírky řas a sinic Botanického ústavu AV ČR v Třeboni, kde mnozí z nás pracují. Práce velmi vhodná pro podnikavé jedince se zlepšovatelskými tendencemi.

Archeologický a paleontologický výzkum řas (Kaštovský, Komárek)

Některé řasy (rozsivky, některé zelené řasy atd.) mají pevnou schránku, která se zachovává v sedimentech velice dlouhou dobu. Ve spolupráci s Laboratoří archeobotaniky a paleoekologie PřF JU zkoumáme ekologické poměry jak archeologických lokalitách, tedy těch, na kterých se nám motá člověk, i na těch paleontologických, tedy zjednodušeně předčlověčích.

Ve vřelé spolupráci s našimi přátelskými institucemi po okolí rovněž něco podnikáme v oblastech:

Elektronová mikroskopie řas a sinic – Laboratoř elektronové mikroskopie je hrozně milé místo na vědeckou práci, jen je pořád přeplněné. Probíhá tam celá řada našich aktivit, jako např. výzkum ultrastruktury sinic pomocí transmisního elektronového mikroskopu.

Ekologie půdních řas a sinic – ten provádíme na Ústavu půdní biologie AV ČR v Českých Budějovicích pod uspěchaným, přepracovaným, ale laskavým dozorem Dr. Aleny Lukešové. Šikovného studenta je schopna zavalit materiálem na deset diplomek, a to okamžitě.

Molekulární biologie sinic – provádí se buď v Laboratoři molekulární taxonomie v Budějovicích pod špičkovou kuratelou Dr. Miroslava Oborníka , a nebo pod vedením vynikajícího Dr. Martina Tichého na Mikrobiologickém ústavu AV ČR na Opatovickém mlýně, kousek za Třeboní. Superperspektivní, leč náročný obor. A oba pánové jsou schopní vás dovést k nejvyšším vědeckým metám, ale taky vás donutí se u toho pěkně zapotit.

Výzkum fotosyntézy řas a sinic – koná se pod dozorem celého teamu Ústavu fyzikální biologie JU na zámku v Nových Hradech. Hi-tech a perspektivní oblast výzkumu.

Biochemie řas a sinic – se zvláštním zřetelem na pigmenty, se děje většinou pod dohledem Dr. Jiřího Kopeckého, který sídlí na Mikrobiologickém ústavu AV ČR na Opatovickém mlýně. Moderní a elegantní metodika, barvitá a barevná.